WM то какой, айс или мыша ? ка оно в мыше не вникал но в айсе иконы, вернее линк файлы котрые потом рисует у тебя на десктопе лежат в ~/.idesktop, а генерирует их тебе кажись скрипт /etc/idesk.functions на основе файлика /tmp/idesk.menu, а его в свою очередь АВТОМАТОМ рожает скрипт инициализации менюхи твоего оконного манагера, для айса это /etc/icewm.functions. Это я к тому что в айсе меню и линки для десктопа рожаются синхронно (при включенном авторисовании икон), шо само по себе в общем "не айс" ((((. Кастомизируя перечисленные скрипты в своей сборке TS ты можешь сделать все чего желается со своим десктопом
, но вот по простому чисто через конфиг файлы наверное сильно не поизвращаешься...
